การเข้าถึงดีเอ็นเอการแสดงออกของยีนด้วยกันในหลายพันเซลล์

ในตอนนี้นักวิทยาศาสตร์ได้ปรับปรุงกระบวนการตรวจพินิจพิจารณาซึ่งมีแบบอย่าง epigenome และก็ transcriptome ของแต่ละเซลล์นับพันเซลล์

epigenome แล้วก็ transcriptome เป็นส่วนหนึ่งส่วนใดของชีววิทยาระดับโมเลกุลที่แปลงพิมพ์เขียวทางพันธุกรรมเป็นวัสดุและก็อุปกรณ์สำหรับเซลล์ที่มีชีวิต

จีโนมของเซลล์ที่ต่างกันบางทีอาจเช่นเดียวกันขณะที่ epigenomes และก็ transcriptomes มิได้ epigenome มีชุดของสัญลักษณ์ที่ระบุว่าจีโนมของเซลล์แต่ละเซลล์จะทำเช่นไรขณะที่ transcriptome เป็นชุดสำเนาของข้อแนะนำด้วยตัวเอง กลุ่มนี้เข้ารหัสการสร้างของโปรตีน การไหลเวียนของข้อมูลที่ได้รับมาจากกลยุทธ์ตกทอดมาสู่การผลิตโปรตีนมีความหมายต่อการผลิตแล้วก็รักษาชีวิต

เซลล์สามารถเข้าถึงเฉพาะเล็กน้อยของโครโมโซมที่ใส่เกร็ดคู่ของพวกเขาในระหว่างการถอดรหัส RNA เพราะว่าการเข้าถึงนี้ต่างๆนาๆในแต่ละชนิดเซลล์ความรู้ความเข้าใจสำหรับการเข้าถึงโครโมโซมจะช่วยสำหรับการระบุทรงการทำงานและก็ความมากมายหลายของเซลล์ที่มากมายในเซลล์ที่มีชีวิตหลายเซลล์

นักค้นคว้าเรียกการทดลองของพวกเขา sci-CAR Sci เป็นแนวทางการทำดรรชนีแบบรวมเซลล์เดียวซึ่งเป็นกระบวนการศึกษาเล่าเรียนปริมาณเซลล์โดดเดี่ยวในคราวเดียว ในรายงานการวิจัยช่วงวันที่ 30 ส.ค.ก่อนหน้าที่ผ่านมาด้านวิทยาศาสตร์นักวิทยาศาสตร์ได้ชี้แจงถึงแนวทางการพินิจพิจารณาแบบใหม่นี้ได้รวมการวิเคราะห์ยีนสองตัวเข้าไว้ภายในโปรโตคอลเดียว

การตรวจพวกนี้รวมทั้งบาร์โค้ดที่ไม่ซ้ำกันสำหรับรายละเอียดกรดนิวคลีอิกของเซลล์หรือนิวเคลียสของเซลล์ซึ่งมีศูนย์ควบคุมหลักสำหรับเซลล์ที่มีชีวิตอยู่ แนวทางการของนักวิทยาศาสตร์สำหรับในการติดฉลากรวมทั้งการจัดลำดับลำดับเซลล์ช่วยทำให้พวกเขาสามารถเชื่อมโยง RNA messenger และก็โปรไฟล์การเข้าถึงได้ของ chromatin ในแต่ละเซลล์

นักวิทยาศาสตร์กล่าวว่าการสำรวจสิ่งที่เกิดขึ้นอยู่กับกรรมพันธุ์ด้านในเซลล์เดียวสามารถตรวจสอบลักษณะทางด้านชีววิทยาของเซลล์ได้เพียงแต่มุมมองเดียว ความรู้ความเข้าใจสำหรับการวิเคราะห์ชั้นเรียนของโมเลกุลหลายที่ในขณะเดียวกันสามารถศึกษาและทำการค้นพบได้เป็นต้นว่ากลไกทางพันธุกรรมอะไรบางอย่างที่เกี่ยวพันแล้วก็ควบคุมได้เช่นไร

นอกนั้นยังสามารถปรับแก้ประโยชน์ต่างๆที่ได้รับจาก atlases เซลล์ของสิ่งมีชีวิตที่สลับซับซ้อนยกตัวอย่างเช่นหนอนหรือเมาส์ สุดท้ายก็บางทีอาจมีคุณประโยชน์สำหรับเพื่อการเก็บรวบรวม Atlas เซลล์ของผู้คน

กระบวนการใหม่นี้ได้รับการพัฒนาโดยนักวิทยาศาสตร์ที่ Brotman Baty Institute for Precision Medicine ในซีแอตเทิลมหาวิทยาลัย Washington School of Medicine แผนก Genome Sciences, Oregon Health Sciences University, Illumina, Inc. ในแคลิฟอร์เนียศูนย์การศึกษาค้นพบแอลเลนสำหรับเพื่อการสืบทอดของเซลล์, รวมทั้งสถาบันการแพทย์ Howard Hughes

นักเขียนคนแรกของการเรียนเป็น Junyue Cao นิสิตระดับบัณฑิตศึกษาสาขาวิชาชีววิทยาระดับโมเลกุลและก็เซลล์รวมทั้งในสาขาวิทยาศาสตร์ทางพันธุกรรมของมหาวิทยาลัย Washington School of Medicine การเล่าเรียนนำโดย Jay Shendure แล้วก็ Cole Trapnell ทั้งคู่เป็นคณะครูในสาขาวิชาวิทยาศาสตร์จีโนมที่ UW School of Medicine แล้วก็นักค้นคว้าที่ Brotman Baty Institute ซึ่ง Shendure เป็นผู้อำนวยการ

ที่ผ่านมานักค้นคว้าอุตสาหะทดสอบร่วมกับเซลล์มากยิ่งกว่า 4,800 เซลล์ในแบบการเพาะเลี้ยงเซลล์ที่ได้จากโรคมะเร็งปอดสำหรับเพื่อการสนองตอบคอร์ติซอล ในลักษณะนี้เซลล์จะได้รับการดูแลรักษาด้วย corticosteroid dexamethasone สเตียรอยด์สังเคราะห์นี้สามารถกระตุ้นการพันตำแหน่งของจีโนมได้แล้วก็แปลงการแสดงออกของยีนหลายร้อยตัว

นักวิทยาศาสตร์ได้สำรวจเวลาของผลของ dexamethasone ต่อการแสดงออกของยีนเหมือนกับความเคลื่อนไหวแบบไดนามิกที่เกิดขึ้นสำหรับเพื่อการเข้าถึง chromatin ในเซลล์เดียวกัน

ในงานศึกษาค้นคว้าและทำการวิจัยที่เกี่ยวโยงนักค้นคว้าอุตสาหะที่จะเล่าเรียนภูมิทัศน์ของการควบคุมยีนที่เป็นฐานรากของคอลเลกชัน RNA ของ Messenger ที่เจอได้ในเซลล์ที่ไม่เหมือนกันในไตของสัตว์กินนม

สำหรับในการใช้การตรวจพินิจพิจารณาร่วมกับนิวเคลียสจากไตวายตลอดตัวพบว่าทั้งคู่มีข้อมูลการเข้าถึงการถอดรหัสแล้วก็โครเมียมจาก 11,296 เซลล์ พวกเขาแบ่งกลุ่มเซลล์ไตของพวกเขาในไตออกเป็น 14 กรุ๊ปรวมทั้งมีลักษณะตำแหน่งที่ตั้งที่เฉพาะของเซลล์ประเภทหนึ่งและก็คุณสมบัติการถอดรหัสที่เชื่อมโยงกัน

นักค้นคว้ายังได้ทำความเข้าใจว่าพวกเขาสามารถดึงความเกี่ยวพันระหว่างส่วนประกอบด้านกฎของจีโนมที่ห่างไกลกับยีนจุดมุ่งหมายของพวกเขาเพื่อชี้แจงไม่เหมือนกันของการแสดงออกของยีนในเซลล์ประเภทต่างๆได้ขึ้นกับความผันแปรร่วมระหว่าง epigenome และก็ transcriptome